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log2相关知识

  • 装饰器学习代码,由浅及深
    import functools def log1(f): def new_test(): print 'call %s()...' % (f.name) return f() return new_test def log2(str): def log1(f): def new_test(*argc,*argv): print '[%s]call %s' %(str,f.name) return f(argc,**argv) return new_test return log1 def log3(str): def log1(f): @functools.wraps(f) def new_test(*argc,*argv): print '[%s]third time call %s' %(str,f.name) return f(argc,**argv) return new_test return lo
  • 批量做T检验出bug怎么办?
    一直感觉在生信入门阶段,盲目的用P<0.05且|log2(FC)|>1筛选差异基因过于robust,会导致很多有意义的差异基因没有筛到。比如说,很多基因log2(FC)=0.99,你说他没意义?这种一刀切的方式很激进,所以才会有GSEA,才会有WGCNA。所以我宁愿只将T检验做初步分析,不会丢掉信息。批量做T检验怎么写?我今天写了一段程序供大家参考一 整理表达矩阵test,KO为敲低组,WT为正常组二 批量T检验pvalue<-sapply(1:15004,function(i){t.test(test[i,c(1:3)],test[i,c(4:6)])[[3]]})突然报错了:Error in t.test.default(D[i, c(1:3)], D[i, c(4:6)]) :data are essentially constant这是为什么呢?我开始查bug,为了看是哪一行出了问题,我将sapply换成了for循环pvalue<-t.test(test[1,c(1:3)],
  • mysql主从同步配置
    准备1. 两台mysql服务器:主(14.152.86.32)、从 2. 主服务器的端口对从服务器开放配置步骤1. master开启bin-log2. slave开启relay-log3. slave关联master(master)主服务器配置配置my.cnf# server 唯一标识server-id= 1# binlog文件名,自定义log-bin=mysql-bin# binlog文件的索引文件,默认为log-bin文件名加后缀.indexbin-log-index=mysql-bin.index# binary log格式: STATEMENT, ROW, MIXED。默认为STATEMENTbinlog_format=mixed查看master状态重启mysql:/etc/init.d/mysqld restart进入mysql查看状态:mysql&
  • 时间复杂度中的log(n)底数到底是多少?
    其实这里的底数对于研究程序运行效率不重要,写代码时要考虑的是数据规模n对程序运行效率的影响,常数部分则忽略,同样的,如果不同时间复杂度的倍数关系为常数,那也可以近似认为两者为同一量级的时间复杂度。 现在来看看为什么底数具体为多少不重要? 读者只需要掌握(依稀记得)中学数学知识就够了。 假设有底数为2和3的两个对数函数,如上图。当X取N(数据规模)时,求所对应的时间复杂度得比值,即对数函数对应的y值,用来衡量对数底数对时间复杂度的影响。 比值为log2 N / log3 N

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