function openWindow(){
 var open=confirm("确认打开新窗口");
    if(open==true){
    var url=prompt("请输入网址","http://www.imooc.com");
       if(url!=null){
        window.open(url,"_blank","width=400px,height=500px,menubar=no,toolbar=no");
        }else{
        alert("bye!");
        }
    }else{
    alert("bye!");
    }
}
    // 新窗口打开时弹出确认框，是否打开
    // 通过输入对话框，确定打开的网址，默认为 http：//www.imooc.com/
    //打开的窗口要求，宽400像素，高500像素，无菜单栏、无工具栏。

你那个prompt那里的判断位置写错了，是在用户点击确定的条件下，再出现提问框，然后判断提问框的url是否为空。

你把第一个if里面的 var url 声明到外面做全局变量 

  function openwindow(){

  var open=confirm("确认打开新窗口");

    // 新窗口打开时弹出确认框，是否打开

    if(open==true){

        var url=prompt("请输入网址","http://www.imooc.com");

    }

  else{

        alert("bye!");

    }

     // 通过输入对话框，确定打开的网址，默认为 http：//www.imooc.com/

    if(url!=null){

        window.open(url,"width=400px,height=500px,menubar=no,toolbar=no");

    }

    //打开的窗口要求，宽400像素，高500像素，无菜单栏、无工具栏。

     else{

        alert("bye!");

    }

  } 

“注意else要对应自己的if”

把第一个else{ alert('bye'); }放到第一个if后面就行了

"_blank"我加上了，还是不行