java源码部署问题（关于jeecms开发）

Question

jeecms有2个包（源码吧&部署包），环境已经配置好了也能运行，因为我是小白，所以有些思想的问题需要请教一下。假设：我远程服务器安装的部署包，然后通过部署包的程序执行网页中的模型栏目，页面标签调取。如果我要是需要根据部分功能进行二次开发，需要使用到源码包，那么我怎么吧本地的源码包修改代码上传到服务器的部署包上？如果我只打算用源码包直接进行二次开发，那么基本的eclipse怎么做到编译然后推送到远程服务器？做到实时更新？源码包 和部署包是只能二选一吗？多谢各位能看到我的提问，我是干PHP的因为公司有个项目是java的需要用到这个框架，单独的安装运行要页面我都已经会了，就是这些思想我不清楚，百度上很多的回复但是太凌乱我很难找到我想知道的“知其然知其所以然”。