如何使用同名的字符变量调用对象

Question

我试图在R中编写一个函数，以类似的方式对一些文件进行批处理分析。这些文件属于类ExpressionSetIllumina..我可以创建一个包含目录中所有文件的名称的字符(字符串)向量，并加载其中的每个文件：list = list.files()for (i in list[1]) {       load(i)}这将正确加载文件。> ls()[1] "i"                     "list"                  "SSD.BA.vsn"> class(SSD.BA.vsn)[1]  "ExpressionSetIllumina"attr(,"package")[1] "beadarray"我现在想做的是用i(字符串)"SSD.BA.vsn")分配对象SSD.BA.vsn到一个新的对象数据，以便：>data = SomeFunction(i)>class(data)[1] "ExpressionSetIllumina"attr(,"package")[1] "beadarray"但是，无论我到目前为止尝试了什么，都只是将数据作为一个字符向量返回，其值与我的值相同，或者根本不起作用。所以我想知道是否有一个函数能帮到我，或者我是否需要用别的方法去做。我将对象或变量的名称作为字符串存储在字符向量中。如何使用字符串对象名对象进行操作？

Answer 1

我想你想get.

data <- get(i)

也就是说，一旦你开始使用get(以及它的对应方，assign)，您通常会得到可怕的不可读代码。

对于像您这样的批处理分析，通常最好将所有数据读入数据帧列表，然后随意使用lapply..类似于：

data_files <- list.files()all_vars <- lapply(data_files, function(file){
  vars_loaded <- load(file)
  mget(vars_loaded, parent.frame())})

mget的版本是get它同时检索多个变量。在这里，它用于检索调用LOAD加载的所有内容。

现在您有了一个列表：顶级列表与文件相关，较低级别的列表包含从该文件加载的变量。