如何使用python组合多个.h5文件（但形状相同）？

Question

如何使用python组合多个.h5文件（但形状相同）？我有 10,000 个 .h5 文件用于 3D 点云。它们具有相同的形状。我想合并（或合并）2000 个文件，所以我总共可以有 5 个大的 .h5 文件。（比如python中的append()函数）我从 h5py( http://docs.h5py.org/en/latest/high/group.html ) 中找到了 copy() 函数。但是，我无法将这种方法应用于我的问题。请参考我的示例代码或帮助我解决我的问题。

Answer 1

你可以简单地做这样的事情（未经测试但应该有效）：

import h5py

def copy(dest, name):

    g = dest.require_group(name)  # create output group with the name of input file

    def callback(name, node):

        if isinstance(node, h5py.Dataset):  # only copy dataset

            g.create(name, data=node[:])

with h5py.File('out.h5', 'w') as h5_out:

    for f_in in files:

        with h5py.File(f_in, 'r') as h5_in:

                h5_in.visititems(copy(h5_out, f_in))

这将为每个文件创建一个“文件夹”（HDF5 组）并递归复制所有内容。