在R中加载泡菜

Question

我正在尝试使用在线找到的以下过程在 R 中加载泡菜对象。首先，我创建一个名为“pickle_reader.py”的 Python 文件：import pandas as pddef read_pickle_file(file):    pickle_data = pd.read_pickle(file)    return pickle_data然后，我运行以下 R 代码：install.packages('reticulate')require("reticulate")source_python("pickle_reader.py")pickle_data <- read_pickle_file("pathname") 但我收到一条错误消息：Error in py_run_file_impl(file, local, convert) :   ImportError: No module named pandas注意我尝试再次安装熊猫，但这并没有改变问题。你知道我应该怎么做吗？

Answer 1

我发现这是一种比制作新.py文件更直接的方法。在 R 代码块中执行以下操作：

library(reticulate)

pd <- import("pandas")

x <- pd$read_pickle("file.pickle")

Answer 2

如果你想将 python 包插入到不同的环境中，在这种情况下是 R，你必须搜索如何在 R 中安装 python 包。在这种情况下，查看CRAN 网页你可以看到为了安装 pandas 在R 的环境你需要命令py_install('pandas')。

希望能帮助到你！

Answer 3

确保已安装 pandas。我建议使用 conda 环境。我阅读了以下步骤的泡菜：

创建 conda 环境并安装必要的软件包。

然后在 R 中，你可以设置正确的 python（在你的 conda env 中是 python）

    Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = "~/anaconda3/envs/your_env/bin/python")

    library(reticulate)

你可以检查py_config()

现在您可以在 R 中读取您的泡菜文件，

    

    loadData = function(file_path){

      require("reticulate")

      source_python("pickle_reader.py")

      

      pd <- import("pandas")

      return (pd$read_pickle(file_path))

    }

    features = loadData(features_path)