rpy2 不会将“_”翻译成“。”

Question

我正在尝试使用使用 rpy2 从 R 导入的函数“read.csv”在 Python 中读取 csv 文件。r_read_csv = robjects.r['read.csv']r_read_csv("initVar.csv", header = True, row_names = 1)但是，上面的代码会返回错误消息：rpy2.rinterface_lib.embedded.RRuntimeError: Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  :     unused argument (row_names = 1)在 R 中，参数的名称是row.names. 但是，我不能使用点，因为它在 Python 中的含义不同。我认为rpy2将“_”翻译成“。”。至少这是我从他们的文档中了解到的。显然，我错了。问题row.names = 1：在这种情况下如何指定？

Answer 1

我确实重现了有趣的错误！它出现read.csv在rpy2不继承其父函数，read.table因此不识别row_names参数。但是，您可以使用read.table确保指定默认值read.csv：

read_tbl = robjects.r['read.table']

rdf = read_tbl("/path/to/data.csv", header = True, row_names = 1, sep = ",")

同样，如果您使用importrutils 包的方法：

from rpy2.robjects.packages import importr

...

utils = importr("utils")

rdf = utils.read_table("/path/to/data.csv", header = True, row_names = 1, sep = ",")

但是，以下内容均不适用于 Python，但适用于 R：

Python

read_csv = robjects.r['read.csv']

rdf = read_csv("/path/to/data.csv", row_names = 1)

utils = importr("utils")

rdf = utils.read_csv("/path/to/data.csv", row_names = 1)

R

df <- read.csv("/path/to/data.csv", row.names = 1)