Docker 中没有名为 conda 的模块

Question

我正在尝试创建一个安装了 miniconda3 的 docker 映像。我不想直接使用docker hub 中提供的基础映像，而是想从头开始创建自己的 Dockerfile 并将 Continumio/miniconda3 映像的 Dockerfile 的命令放在那里，这些命令是：FROM debian:latest#  $ docker build . -t continuumio/miniconda3:latest -t continuumio/miniconda3:4.5.11#  $ docker run --rm -it continuumio/miniconda3:latest /bin/bash#  $ docker push continuumio/miniconda3:latest#  $ docker push continuumio/miniconda3:4.5.11ENV.UTF-8 LC_ALL=C.UTF-8ENV PATH /opt/conda/bin:$PATHRUN apt-get update --fix-missing && \    apt-get install -y wget bzip2 ca-certificates curl git && \    apt-get clean && \    rm -rf /var/lib/apt/lists/*RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \    /bin/bash ~/miniconda.sh -b -p /opt/conda && \    rm ~/miniconda.sh && \    /opt/conda/bin/conda clean -tipsy && \    ln -s /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh /etc/profile.d/conda.sh && \    echo ". /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.bashrc && \    echo "conda activate base" >> ~/.bashrcENV TINI_VERSION v0.16.1ADD https://github.com/krallin/tini/releases/download/${TINI_VERSION}/tini /usr/bin/tiniRUN chmod +x /usr/bin/tiniENTRYPOINT [ "/usr/bin/tini", "--" ]CMD [ "/bin/bash" ]构建和运行容器效果很好。conda info作为参考，以下是容器中的输出：(base) root@def48bd1ed5d:/# conda info     active environment : base    active env location : /opt/conda            shell level : 1       user config file : /root/.condarc populated config files :           conda version : 4.5.11    conda-build version : not installed         python version : 3.7.0.final.0

Answer 1

miniconda3Dockerfile 内的安装行中指定的版本不是最新版本

您用于构建本地映像的Dockerfile将安装miniconda3-4.5.11不是最新版本。你可以在这里找到它：

...

RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \

    /bin/bash ~/miniconda.sh -b -p /opt/conda &&

...

也以这种方式docker：

$ docker build --tag miniconda3:test .

$ docker docker run -i -t miniconda3:test /bin/bash

$ docker history --no-trunc miniconda3:test | grep Miniconda3

/bin/sh -c wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && ...

好吧，现在我们看一下官方continuumio/miniconda3：

$ docker run -i -t continuumio/miniconda3 /bin/bash

进而：

$ docker history --no-trunc continuumio/miniconda3 | grep Miniconda3

/bin/sh -c wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && ...

正如您所看到的，continuumio/miniconda3DockerHub 中的映像安装的是最新版本miniconda3 4.8.2，而不是4.5.11版本。因此，从中构建的本地映像Dockerfile将生成带有miniconda3:4.5.11.

python版本变更中断conda

现在，让我们找出conda失败的原因。首先构建并运行：

$ docker build --tag miniconda3:test .

$ docker docker run -i -t miniconda3:test /bin/bash

获取一些信息：

(base) root@61cafd17d954:/# conda info

     active environment : base

    active env location : /opt/conda

            shell level : 1

       user config file : /root/.condarc

 populated config files : 

          conda version : 4.5.11

    conda-build version : not installed

         python version : 3.7.0.final.0

       base environment : /opt/conda  (writable)

           channel URLs : https://repo.anaconda.com/pkgs/main/linux-64

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/main/noarch

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/free/linux-64

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/free/noarch

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/r/linux-64

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/r/noarch

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/pro/linux-64

                          https://repo.anaconda.com/pkgs/pro/noarch

          package cache : /opt/conda/pkgs

                          /root/.conda/pkgs

       envs directories : /opt/conda/envs

                          /root/.conda/envs

               platform : linux-64

             user-agent : conda/4.5.11 requests/2.19.1 CPython/3.7.0 Linux/5.4.0-48-generic debian/10 glibc/2.28

                UID:GID : 0:0

             netrc file : None

           offline mode : False

好吧，我们conda:4.5.11有python:3.7.0。

现在，我们要安装jupyter，例如：

(base) root@61cafd17d954:/# conda install jupyter

您可能会注意到，此安装将更新python：

The following packages will be UPDATED:

...

    python:             3.7.0-hc3d631a_0        --> 3.8.5-h7579374_1       

...

如果继续，这将更新python并会中断conda：

...

Preparing transaction: done

Verifying transaction: done

Executing transaction: done

Traceback (most recent call last):

  File "/opt/conda/bin/conda", line 7, in <module>

    from conda.cli import main

ModuleNotFoundError: No module named 'conda'

更新conda或Dockerfile使用miniconda3:latest

此问题有 3 种可能的解决方案：

1. Dockerfile通过替换此行来编辑您的：

RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \

和

RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \

1. 使用最新的官方Dockerfile版本。

2. conda使用前更新容器内部：

(base) root@61cafd17d954:/# conda update conda